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  • 包其郁:奔走在探索科学真理的路上
  • 编辑:李珊珊   来源:检验医学院、生命科学学院   编辑:小玲   浏览:4406
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    包其郁,温州医学院检验医学院、生命科学学院教授,博士生导师,享受国务院政府特殊津贴。现从事《微生物学》、《基因组生物信息学》、《生物化学》和《法医物证学》的教学和科研工作。2002年在中科院遗传与发育生物学研究所获博士学位,参加了“人类基因组计划”和“水稻基因组计划”,为第一编辑完成了“腾冲嗜热厌氧菌全基因组分析”,该研究为国内首次获得了一张原核生物全基因组序列图谱,填补了我国在此研究领域的空白。曾主持国家自然科学基金项目和省级科研基金项目各两项;近三年以第一或通讯编辑发表的SCI收录论著近10篇;先后获“中国科学院院长特别奖”、浙江省科技进步奖(三等奖3项)。

     

    拓荒者——科研篇

     

    能在枯槁平淡的生活中,找到生命滋生的沃土,这就是一种美。

     

    1999年,包其郁加入“1%人类基因组计划”的项目。在该计划中,负责BAC亚克隆文库构建,每天要为100多板模板提供上万个克隆——面对连天匝地的工作量,他觉劳苦,反而觉得是生活的释怀,觉得能有幸参加全世界6个国家、16个实验室共同解码人类生命的微妙,是一生的荣幸。项目完成后,他获得北京华大基因研究中心“1%人类基因组计划工作框架图完成员工嘉奖一等奖,并参与发表了两篇刊登于《Nature》上的有关人类基因组框架图和精细图的文章。他们手不释卷的精神创造了中国生物产业历史性的转折。

    这是他与基因组的第一次邂逅,也让他与之结下了不解之缘。

     

    面对上世纪90年代中国羽毛未丰的生物产业,为了给 1%计划打造一个技术平台。包其郁带头投入了对中科院重大课题----腾冲嗜热厌氧菌全基因组测序的研究。当时每天工作16个小时,凌晨2点睡觉,他们仅用半年多的时间,就揭开了腾冲嗜热厌氧菌的全基因组的神秘面纱。这是当时全球第46个原核生物基因组,国内第一张原核生物全基因组的序列图谱。以其为第一编辑在世界权威杂志(Genome Research,影响因子达10)上发表了相关论文,基于以上贡献,他于2002年被授予中国科学院院长特别奖

     

    带着对科研的固执,他走的每一步都是这样铿锵有力。博士毕业时,中科院遗传与发育生物学研究所极力挽留他留在中科院,但他毅然背起行囊,回到温州医学院,让基因组生物信息技术这颗种子在温州医学院的土壤里生根发芽。

     

    他曾于2006-2007年连续两年获得两项国家自然科学基金项目资助(1.螺旋藻基因组的生物信息分析;2.人体内和细胞传代培养SARS病毒基因组的遗传变异研究)。他领导下的课题组现主持国家自然科学基金、浙江省自然科学基金项目、浙江省科技厅项目多项。近几年来,他在“Nature”、“Science”、“Genome Research”、“Nucleic Acids Research”等世界著名杂志上发表了20多篇SCI收录文章(总影响因子达150)。

     

    科研的道路并不像流星划过时的美丽,它的美在于孜孜不倦地努力。老师共事的老师们会经常发现他为了做实验而废寝忘食,也许这就是常说的科研精神。在老师的身上,你不能找到科研工作带来的一丝疲惫,反而看到的是更具张力的生命。

     

    开拓者——学科建设篇

     

    上世纪90年代初,温州医学院的第一个分子生物学实验质粒DNA电泳由包其郁和周丽萍两位老师一起完成。当时温州医学院微生物教研室的实验室里,十分简陋,连跑胶的电泳板都要亲手设计与制作。经过几年的努力和人才培养,在学校领导的支撑下,终于在1997年建成了我校第一个分子生物学研究中心,包其郁老师就是当时的第一任主任。

     

    在多年的生命科学研究工作中,他发现任何领域都离不开生物信息学技术,21世纪就是生物信息的时代!因此,他又投身于加强本科生对生物信息技术的认识——在2005年,于我校的生命科学专业第一次开设信息与数据处理课程。亲自编写讲义,每堂课的常识点都是经过他细心雕琢的,因为他觉得现在的学生就是将来科研的主体,老师必须成为一盏明亮的指路灯。

     

    除了学习以外,还应该给学生一个发挥才能的平台。于是,2006年的时候,老师就憧憬着能在我校建立一个生物信息学研究平台。当时,学校没有设备——他毅然向学校借了六万块钱,买了一台服务器,八台电脑。在几张破旧的木板桌上,支撑起了我校“生物医学信息研究所”。没有人才——他每年都派送学生到北京华大、杭州华大等单位学习。就是在这样的环境下,基因组生物信息研究起步了。五年的坚持下,现在的它已经拥有一个小型品牌服务器、二十几台电脑、能进行微生物基因组等研究的平台。然而,老师并没有停止努力的步伐,终有一天温州医学院将具备一个更强的生物信息研究所。

     

    师者——育人篇

     

     “你的兴趣是什么?”——这是每个研究生报到时,包老师问的第一个问题。他认为,在研究生的培养中,重点在于把握学生的兴趣所在。对于有才华的学生,就尽量给他们创造学习机会,将他们送至华大基因、中科院有关院所等高等学府进修。正是因为这种因材施教的理念,才会让学生的才华发挥到最大化,所以温州医学院硕士研究生发表论文的历史上,首篇SCI收录且影响因子大于4的文章由他的首席弟子吴金雨于2007年独立完成,值得一提的是,这也是温州医学院历史上,首篇由温州医学院为主完成的,影响因子大于4SCI收录文章。

     

    他对学生的培养意识,一直未曾淡化过。他是2009年和2010年浙江省大学生生命科学竞赛的省专家组成员,也是我校该项竞赛的首席引导师,在他的帮助下,我校在这两届的竞赛中都取得了不俗的战绩,总成绩都排在全省所有参赛高校的第二。更且,他亲自带领学生参与第二届生命学科竞赛,并获省二等奖。他希翼能够通过自己的行动,呼吁更多的教师和学生参加到科研的行列里来。

     

    与此同时,老师一直以身作则,告诉学生做人做事做科研都要有一鼓作气的劲儿。他所带竞赛小组的学生感叹:“虽然老师是一个大教授,但他做事的认真和细心让你赞叹,他可以找出PPT中一个英文单词的拼写错误,如果发现错误,一定要重新检查一遍。”习惯来自时间的历练,这种严谨的生活习惯已经成为他生活中不可泯灭的人生态度。

     

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